Kritiken

Die Hauptkritikpunkte gegen das Tribunal bezogen sich auf die fehlende Verfolgung von Kaiser Hiro Hito, dem vorgeworfen wurde, der wichtigste Kriegsverbrecher des japanischen Krieges gewesen zu sein, zudem auf die Freilassung der restlichen Verdächtigten der A-Kategorie Verbrechen sowie die fehlende Strafverfolgung der Mediziner der Einheit 731, denen vorgeworfen wurde, an chinesischen, russischen und amerikanischen Kriegsgefangenen medizinische Versuche durchgeführt zu haben und den Tod von mindestens 9000 Menschen verursacht zu haben. Die Tatsache, dass Aufbau und Verwaltung des Tribunals stark von den USA dominiert wurde, erweckte bezüglich IMTFE noch stärker den Anschein von Siegerjustiz als dies schon beim Nürnberger Tribunal der Fall gewesen war.

Obwohl das IMTFE im Oktober 1948 aufgelöst wurde, wurden insbesondere im Rahmen von US Militärkommissionen im Pazifik weitere Urteil gegen Kriegsverbrecher des Zweiten Weltkrieges gefällt. Auch in der, unter den alliierten Staaten gemäss Sektoren abgestimmten nationalen Strafverfolgung kam es zu einigen Verurteilungen.