Jean de Dieu Kamuhanda est né le 3 mars 1953 à Gikomero, dans la préfecture de Kigali-Rural au Rwanda. Le 25 mai 1994, il a été nommé Ministre de l’Education Supérieure, de la Recherche Scientifique et de la Culture au sein du gouvernement intérimaire, remplaçant dans ce poste le Dr. Daniel Nbangura. Il a occupé ce poste jusqu’à la mi-juillet 1994.
Kamuhanda a joué un rôle de premier plan dans l’extermination systématique des Tutsis qui s’étaient réfugiés dans la paroisse et l’école de Gikomero dans la préfecture de Kigali-Rural au Rwanda en 1994.
Entre le 6 et le 10 avril 1994, lors d’une réunion qui s’est déroulée chez un de ses cousins à Gikomero, Kamuhanda se serait adressé aux personnes présentes pour rappeler que les tueries contre les Tutsis n’avaient pas encore commencé dans la commune de Gikomero. Il les aurait incitées à commettre les massacres et il aurait précisé qu’il amènerait des armes afin que les personnes présentes puissent commencer les massacres. A la fin de cette réunion, il aurait personnellement distribué des armes à feu, des grenades et des machettes et aurait dit aux personnes présentes qu’elles devaient distribuer ces armes à d’autres personnes. Il aurait souligné qu’il repasserait plus tard pour voir si les massacres avaient bien commencé.
Après le début des massacres contre les Tutsis en avril 1994 au Rwanda, de nombreux civils Tutsis de la préfecture de Kigali-Rural ont trouvé refuge à la paroisse protestante de Gikomero et à l’école attenante à celle-ci. Le 12 avril 1994, Kamuhanda aurait mis en œuvre l’attaque contre les réfugiés Tutsis qui s’y étaient réfugiés, en conduisant des hommes armés à la paroisse; il y serait arrivé en début d’après-midi, accompagné d’Interahamwe (milices extrémistes Hutues), de policiers, de soldats et de civils, sous son autorité. Il leur aurait donné l’ordre de commencer les tueries. Ensuite Kamuhanda aurait quitté les lieux. De nombreux Tutsis sont morts lors de cette attaque.
Face à l’avancée des troupes du FPR (Front patriotique rwandais, mouvement d'opposition composé essentiellement de réfugiés Tutsis et dirigé par Paul Kagame), Kamuhanda a fui le Rwanda. Le 26 novembre 1999, il a été arrêté dans un foyer de la ville de Bourges, en France.
Trial Watch rappelle que jusqu'à ce qu'une éventuelle condamnation soit entrée en force, toute personne accusée ou poursuivie par une juridiction nationale ou internationale est présumée innocente.
