Khalid Cheikh Mohammed a été transféré à Guantanamo en septembre 2006, en provenance d’une prison secrète.
Les premières auditions devant les commissions militaires instituées pour juger certains détenus de Guantanamo ont eu lieu en mars 2007.
Le 11 février 2008, Khalid Cheikh Mohammed et cinq autres responsables d'Al-Qaïda ont été formellement inculpés de conspiration, terrorisme et meurtre par les commissions militaires.
Trial Watch rappelle que jusqu'à ce qu'une éventuelle condamnation soit entrée en force, toute personne accusée ou poursuivie par une juridiction nationale ou internationale est présumée innocente.
